Le principal inconvénient d’une citerne souple est que sa durée de vie, même si elle s’est largement améliorée depuis quelques années, n’est pas très importante. Elles n’ont qu’une durée de vie de 5 à 10 ans, ce qui n’est pas très avantageux.

Si vous décidez de vous équiper d’une citerne souple, il est très important d’entretenir correctement celle-ci, surtout si il s’agit d’une citerne souple ouverte. Si votre citerne est mal entretenue, sachez que l’eau collectée risque d’être impropre à la consommation, ce qui peut être très dangereux. Il est donc primordial d’entretenir régulièrement votre citerne souple. Sachez également que le gouvernement peut vous accorder un crédit d’impôt pour l’installation d’un système de récupération d’eau de pluie. Pour pouvoir en bénéficier, il est important de respecter certaines règles concernant les équipements, les habitations, et l’utilisation de l’eau de pluie stockée :

Une utilisation stricte du système de récupération d’eau de pluie : L'eau de pluie collectée doit être un dispositif ou l'eau est utilisée soit à l'extérieur du bâtiment (pour l’arrosage du jardin ou le lavage d'une automobile par exemple), soit à l'intérieur du bâtiment (pour l'évacuation des toilettes, le lavage des sols et le lave-linge). L'eau destinée à la consommation humaine est interdite.

 L'habitation doit être le logement principal et doit concerner des équipements de récupération et de traitement des eaux pluviales payés entre le1er janvier 2007 et le 31 décembre 2009.

Les équipements doivent impérativement être fournis et installés par une entreprise spécialisée. Cette installation doit être réalisée par un professionnel qui vous remettra une facture attestant de votre investissement et de l'éligibilité des équipements installés. Il est indispensable de bien sélectionner le type de matériel pour collecter l'eau de pluie sous risque de ne pas entrer dans les critères d'éligibilité (voir arrêté du 3 octobre 2008).